朱允炆这个做法，让朱棣感到气愤，却又没有任何办法，只得叮嘱三个儿子替自己入京吊孝，可他的话里分明不同意。明眼人都看得出来，朱允炆这是想以燕王的三个儿子为质，约束燕王的行为。燕王同道衍大师谈话，近日朱允炆已经让黄子澄和齐泰同参国事，虽然没有明说要设立丞相，可朱棣认为他这是巧立名目，改弦更张，可父皇薨逝不过一个月，朱允炆就敢这么做。另，朱允炆的年号已经定下，名为建文。开国皇帝为武帝，继者为文，这本无可厚非，可朱棣是个武人。

道衍差人抄了先帝的遗诏，根据遗诏上所说，现在朱棣能节制安排的兵马，恐怕只有护卫王府的三卫兵马了。朱棣才刚刚失去父皇，根本无暇看遗诏，更不知道还有这回事。道衍不得不提醒他，新帝登基要推行新政，首先要集中事权，那么第一个要对付的就是像朱棣这些德高望重的宗王。看到朱棣身陷悲痛，道衍一时情急，对他没有了该有的礼节，这倒是让朱棣清醒。很快，建文帝朱允炆叫来大臣商讨该如何削藩，该什么时候削藩。徐允恭想说服他不削藩，可他话还没说完，就被朱允炆打断了。

燕世子及其两个郡王都在京师，朱允炆不怕朱棣，因此先从五叔周王下手，他把这个棘手的差事交给了李景隆。周王被抓后，朱棣写了一封奏表，不偏不倚，道衍大师说这封奏表极好，日后朝廷如果继续削藩，只能先削那些时有不法的宗王，如果要对朱棣削藩，那天下都可看到朱棣的冤屈了。马和进来禀告朱棣，他在花园外看到了葛长史，朱棣略微一想，便让马和把这封奏表交给葛长史，然后让葛长史将奏表带回京师。听完朱棣的奏表，铁铉脸色凝重，夏原吉亦看透了，燕王此后必不会自安的。

不久之后，建文帝连削四王。道衍再次提醒朱棣，这四位亲王曾有不法事，因此从建文帝的角度来看，他做得没错。接下来，朱允炆要动的是湘王朱柏，盛庸负责此事。可当他赶到湘王府，却看到府上火光一片，湘王朱柏携其王妃，自焚而死。朱允炆这才意识到事情的严重性，可方孝孺还让他继续议湘王的罪，毕竟朝廷的体面要紧。朱允炆自小与湘王朱柏一起长大，不可谓没有感情，因此湘王死了，他亦非常痛苦，可这也是他一手造成的。

朱棣听到此噩耗，又看到朝廷给湘王恶谥，竟悲至吐血，不久后生病发疯。铁铉有本启奏，为湘王和燕王鸣不平，夏原吉等官员跟着附议。下朝后，朱允炆立刻下旨将铁铉和盛庸贬离朝廷。王府养起了鹅，对外理由充分，实则是借鹅叫声掩盖地下密室的打铁声。朝廷张昺张大人来看朱棣，实际上是试探其是否真的装疯卖傻。燕王妃则将朱棣的脉案和几位郎中的住处都告诉这几位大人，并让他们代呈朝廷，望陛下准允朱棣的三个儿子回来看看他们的父亲。

山东是北平南下的必经之地，所以铁铉选择在山东任职。夏原吉听懂了铁铉的意思，他说朝廷怕是用不到铁铉了，因为陛下近日在大量调拨军资，他已经先下手为强了。朱允炆已经准允燕世子携其兄弟回北平，他还故作关心状叮嘱他们回去好好照顾朱棣。朱棣的二儿子朱高煦偷了徐允恭的马，抛兄弃弟独自回了北平。不久后，海别和乌兰图雅也离开了京师，身后是依依不舍的朱允炆。妙锦和徐增寿送燕世子等人上马，目送他们离开。

斥候传回消息给北平，后军都督府都督佥事耿瓛，是长兴侯的三子，率步骑三万，已进驻山海关。朱棣看得清清楚楚，长兴侯的长子娶了朱允炆的亲姐姐，所以在朱允炆的眼中，这才是自己人，朝廷围在北平外的军力已有九万余众。本以为朱棣手里还有燕山三卫的一万六千兵马，但张武进来告诉他，都司那边刚得到消息，朝廷已下令调燕山三卫赴开平统归宋忠节制，另调两卫边军接管北平城防。不仅如此，陈亨也转任大宁行都司都指挥使。

朱棣得知朱高煦回来的消息，便询问朱高炽和朱高燧是否回来。对于抛兄弃弟，单独回北平的朱高煦，妙云恨铁不成钢，生气地鞭打他，后被朱棣阻止。随后，朱高炽和朱高燧也回来了，令人意外的是，随同他们回来的还有海别。海别同朱棣说了一些话，都是关于先帝临终前所说的话，朱棣相信她所说的是真的，他也有信心能守好北平。朱允炆下令，捉拿道衍及其燕王府一干不法官员，张大人和谢大人随同军队一起前行。

朱棣以天子之叔，却不能保旦夕之命，被逼到如此地步，还有什么不可为，朱棣欲策反张谢，可两人不愿意，最后被朱棣斩首。其余的军士，忌惮朱棣，结果追随了他。文人不识趣，这些武人倒更识相一些。公元1399年，明建文元年七月，朱棣以八百亲卫在北平起事，北平守军倒戈相从，靖难之役爆发。朱棣起兵，事出有因，因此追随他的军士众多，他的理由亦非常充分。朱允炆十分生气，方孝孺却贺他，声称燕王朱棣已经自绝于先帝和天下，陛下可无忧矣。

宋忠骗手底下的燕山三卫说朱棣已经杀害了他们的家人，因此起兵后，燕山三卫无人来投。朱棣胜券在握，根本不担心。次日，燕山三卫的诸多家人眷属随同朱棣一起前去，呼喊燕山三卫开城门投降。刹那间，宋忠就被杀了，燕山三卫倒向朱棣。朱允炆宣曹国公李景隆觐见，李景隆却建议陛下召魏国公徐允恭入宫觐见。徐允恭提到了宁王朵颜三卫，同时表示自己愿意为陛下分忧，前往宁王处接管宁王兵马，可朱允炆仍然防着他，所以没答应。

朱允炆在朝上下旨后，提醒长兴侯勿让自己担上杀叔之名，皇太后吕氏为此不满，觉得儿子这是妇人之仁，朱允炆不以为意。而朱棣听闻此事，嘲讽自己竟然不知道还有如此孝顺的侄儿，宁王朱权分给陈亨的兵马不多，朵颜三卫亦不在其列，理由是附近有元人骑兵出没，不可派出去太多军卫。朝廷的二十万兵马在真定和松亭关止步不前，朱权也敢首鼠两端，朱允炆不免担心，届时会有别的藩王对朝廷生出轻视之心。

如果诸藩合流，朱允炆自知这个皇帝便无法自处了，所以这一仗无论如何都要打，他拟谕旨给长兴侯，令他务必持重用兵。朱棣手法诡谲，在对付雄县和莫州时，不费一兵一卒，便把这两处兵马全部端了。张武和张玉的儿子张辅在此战中，功不可没。长兴侯耿炳文得知此事，大发雷霆，他下令将这些失责的将领拉下去等候朝廷发落。此战，长兴侯已然尽失先机，他下令让顾成率军回师真定，三日后在城外合营。

朱棣允许耿炳文和顾成两部军马合营，张玉不解。朱棣解释说，耿炳文素来用兵谨慎，他若是守真定，他肯定会在城外下寨，到时候哪些兵该进城，哪些兵留在城外，则是一个学问。朱棣之所以无视他们合营，是想让耿炳文觉得他见好就收，不敢轻举妄动，然后耿炳文就敢把全部大军都留在真定城外。耿炳文所部本就是各地抽调军马，不相统属，朱棣利用这一点，适时出兵，此战可定。

长兴侯刚下达好命令，就听到外边一阵喧哗，有人偷袭大营，眼见场面难以控制，在属下掩护下，耿炳文跑掉了，可老将军顾成被抓。朱棣并未为难他，相反，对他尊敬有加，命人赶紧给他松绑，送下去休息。耿炳文打算死守真定，朱棣了解他守城的功夫颇深，当机立断班师回营，不再耗时在真定城。朱棣明白，此后朝廷必举全力兴战，而燕军军士加起来也才十万，打是打不过的，朱棣下令让张玉统率大军返回北平，同时带回顾成，叮嘱燕王妃好生照顾顾老将军。

看到燕王妃对自己礼遇有加，顾成终于动摇，倒向了燕王这一边。朝廷这边，方孝孺建议对逆徒严加惩治，治顾成之罪。很快，朱允炆在朝上下旨，捕拿顾成等人，旨到之日，就地斩杀。至于长兴侯耿炳文，等选定另外大将军后，回京听勘。朱棣带了张玉之子张辅去见陈亨老将军，陈亨不便出行，让郑亨代替自己与朱棣见面。郑亨告诉朱棣，顾成老先生的四子皆被陛下斩首，而陈亨已经决定誓死追随燕王。

郑亨代为转告朱棣，陈亨说此时不宜去找宁王，自兴兵以来，宁王持观望态度，若朱棣贸然找上门去，宁王可能会对他不利。但大宁是一定要去的，只是不是现在，等朝廷大兵来袭之日，就是朱棣进军宁王大军之时。道衍建议朱棣让妙云写封信给徐允恭，朱棣知道妙云会为难，却不知她早就写好了信，只希望朱棣到时候留徐允恭一命。朱棣问她为何确信自己会赢，妙云信誓旦旦地说，自父皇和先太子之后，便无人再是朱棣的对手了。

妙云的离间计生效，妙锦也不着痕迹地将特地剪开的信给了宫里太监，朱允炆于是看到了妙云写给徐允恭的信，齐泰谏言，不可派魏国公去讨伐燕王。而这个大将军的人选，自然落到了李景隆的头上。李景隆将大军停在了河间府，徐允恭立刻进宫，向朱允炆提进军建议。他所提议的用兵法，听起来不错，终是说服了朱允炆，朱允炆立即下旨传给河间府的李景隆，让他即刻出发前往北平。