蒋介石提出《整理党务案》,以不可跨党的方式欲将共产党的势力清除出国民党。中共方面只有毛泽东一人坚决反对。无奈势单力孤,孤掌难鸣。在《整理党务案》的阴影之下,大批共产党员只得退出国民党,毛泽东亦离开了国民党宣传部。毛泽东来到农讲所,开始全心投入农讲所的工作。
蒋介石到农讲所旁听毛泽东的课,被毛泽东当众点名提问,一番不容回避的质问,令他下不来台。虽然受到蒋介石的不公平待遇,由周恩来、聂荣臻和黄锦辉三人组成的广东区委军委依然联合叶挺独立团积极筹划协助北伐的工作。朱德、邓小平等也为支援北伐回到国内。陈独秀指示朱德暂时不要公开自己的党员身份,借机策反四川军阀杨森,同时接近蒋介石。
邓小平被派到西北劝冯玉祥处,协助成立黄埔二期的工作。毛泽东带着农讲所师生到彭湃处实习,动员他们响应革命,并且在田间地头为他们举行了结业典礼。在国共双方的共同努力下,北伐战争高奏凯歌,共产党员们立下了赫赫战功。
毛泽东却与陈独秀为了农运问题发生争论。毛泽东到湘赣考察农民运动,受到当地农民的欢迎,启发良多,却不知一直视他为眼中钉的军企图除他而后快。在当地农民的帮助下,毛泽东从军阀的追捕中安然涉险。
中共进攻上海的武装起义失败,陈独秀将毛泽东调往上海出任农委书记,等待周恩来抵沪一起准备二次起义。蒋介石秘密开始接触黄金荣等上海巨孽,以军事势力为筹码聚集资金,图谋不轨。陈独秀与毛泽东的关系似有缓和,但毛泽东为参加湖南省工农代表大会而拒绝参加中央的会议,两人再度不欢而散。
在黄金荣的穿针引线之下,蒋介石终于与当地外商买办达成条件,为了防止中共抢先一步占领上海,一面密电前军停止进攻上海,一面又串通黄金荣在周恩来身边安插内线。蒋介石为稳固自己的地位,决定取得中山先生最大的遗产——进而打起了宋庆龄的主意。上海第二次武装起义因为准备不足再度流产,周恩来等人继续筹划第三次起义。