林涛开车带着大宝，大宝认为秦明的案件有很大的疑点，而且凶手对秦明十分了解，并将所有的证据都指向秦明。大宝很不明白，秦明平常的生活就是工作，怎么会有仇家。林涛提议应该先从秦明侦办过的每一起案件查起。

大宝将所有秦明侦办过的案件档案袋都找到，连夜在解剖室寻找疑点，堆成山的档案袋里大宝细心的寻找着，一份花了两年时间才结案的案件引起了她的注意。这件案子发生在2010年，一个女生躲在车里大喊救命，一个蒙面黑衣人砸碎玻璃将她带走。后来警方抓住了犯罪嫌疑人，并在嫌疑人家里找到了赃物，但是DNA比对结果不符合，局长很是疑惑，怀疑是秦明的检测结果出了问题，但是却凭借自己的经验断定嫌疑人就是这个人，因为他有两次前科。后来，犯罪嫌疑人也亲自画押认罪，后来秦明才明白犯罪嫌疑人因为曾经做过骨髓移植而改变了DNA。大宝受到启发，现场遗留的DNA很可能是接受过秦明造血干细胞移植的人。

林涛和大宝去附近的所有可以做造血干细胞移植手术的医院寻找证据，终于功夫不负有心人，在最后一家医院找到了一个秦明曾经的捐献者，张超，凶手果然还是留下了线索。而且主治医师一栏是空的，更加说明有问题。局长命令林涛对犯罪嫌疑人张超进行抓捕，但是大宝却因为在休假期间违反规定，停职查勘。

大宝很失落，一个人离开警局。此时的秦明在拘留所中有些绝望。

林涛带队抓捕张超，犯罪嫌疑人的家里没有找到人，却找到一把解剖刀，突然听到动静，一个男子逃跑，林涛赶忙追上，追了很远终于追到。

张超被抓回局里，案件真相大白，秦明也可以被释放了，大宝和林涛等在监狱门口，看到秦明很高兴。秦明也很高兴，向大家道谢，才得知大宝被停职查勘，大宝安慰秦明，就当你给我放个假，没准我就相亲成功了。

审讯室里，秦明见到张超，两个人对峙，秦明问你同伙是谁？张超却说没有同伙。秦明质问，你的个人简历说明你根本没有这样的专业知识和经验，尤其无法造成罗钥身上一刀毙命的伤。张超依旧不改口，说没有同伙，就算有也是你秦明，因为我们流着同样的血。秦明有些发怒，恶狠狠地对张超说，那我为我的血感到恶心，你不要忘了，你就是一个傀儡。

大宝晚上一个人回家，感觉有些不对，终于安全回到家里，躺在沙发上就睡着了，秦明打来电话说要一起吃饭。大宝有些困，但是还是答应了秦明。

警局开会，即使抓住了张超，但是还有同伙在外面，所以要继续查案，从张超身边的人查起。

大宝在去池子厨房餐厅的路上被打了一棍晕倒。

秦明和林涛等了很久，林涛建议秦明，一会儿大宝迟到了千万别怪她，她为了你的案子最近几乎没有睡觉。秦明有些无奈，问林涛自己在你们眼里就这么不通人情吗？林涛列举了秦明一系列奇怪的地方。秦明无奈，问自己是不是得罪了很多人？林涛说当然。

这时，秦明的手机响了，是大宝。接起来，却是一个女人，说大宝在我手里，威胁秦明不要惊动任何人。

秦明没有说话，听着电话里女子的声音，女子问你还记得四年前的水良案吗？秦明终于想起，你是水良的妻子池子。池子发来视频，大宝被关在一个水箱里，依据水流的数度还有一个小时水就会淹没大宝的鼻子。

视频里有光，是灯塔，秦明打车去灯塔集中的新龙湾。水箱里的大宝只有微弱的意识，身边的一个女子正在拿针头取药，转身，大宝认出这是池子厨房餐厅的老板娘，大宝意识到，一直在陷害秦明的就是她。池子威胁大宝，让她打电话让秦明来救她，大宝拒绝了池子，池子将药注射到大宝身体里，大宝再一次晕了过去。

秦明推测着大宝的位置，他很着急，电话里，池子将这四年自己为了复仇，步步为营，辞去了医生的工作，开了池子厨房餐厅，慢慢的接近秦明，最后终于嫁祸秦明让他成了杀人凶手，但是大宝救了他。

秦明找到池子，大喊着，有什么事情冲我来！池子却在暗处说，给你一个选择，要不杀了我，要不看着大宝死。秦明质问，你想让我干什么？池子让他跪下，看着自己。秦明跪下，池子很得意，说自己当年在法医办公室门口苦苦求你，可是你却很冷漠。秦明说，不要再为这个案子纠结，水良不值得。

池子开始回忆，那一年，自己就要嫁给水良，原本自己是一个可以得到幸福的女人，但是婚礼当场，水良却被警察抓走，池子很难过，悲伤的喊叫着：“他是我老公，不是嫌疑犯！”池子晕倒了，自己的父亲也受不了打击，当天脑淤血死亡了。就是因为秦明，池子失去了两个最爱的人。

秦明也很愤怒，我只是做了我职责让我做的事，从来没有想过破坏你的家庭和幸福。你的幸福本来就是一个虚妄的幻觉，水良是一个强奸杀人犯，五个受害者的身上都有他的NDA。真相不会因为观察者存在而改变，你可以否认水良是一个杀人犯，但是受害者的家属不能否认，每一个死者都摆向我的面前，我可以否认吗？

池子完全没有听进去秦明的话，她说自己不介意水良是不是杀人犯，他就是自己最爱的那个人，而这一切都是秦明毁了的。

秦明看着水箱里的大宝，水已经快要淹没她的。秦明让池子杀了他吧，然后放了大宝。池子拿枪指着秦明，告诉他即使你死了，大宝也会被淹死，你就带着内疚去死吧。

这时候林涛及时赶到，开枪打伤了池子，也同时被池子打伤。秦明赶忙去救大宝，但是水箱打不开，唯一的钥匙在池子肚子里，秦明可以拿，但是那样他就是一个杀人犯了。池子得意的笑着，秦明不知道该怎么办，脑海里都是自己小时候看着父亲死去的场景，他拿起解剖刀，走向池子，林涛试图阻止，让秦明不要冲动，但是秦明执意走向池子，林涛无奈拿枪指着秦明，让他冷静。

池子说，自己所有的幸福都在水良给她戴上戒指的那一刻停止了，这一切都是因为秦明。

戒指，秦明想到戒指上钻石的硬度是可以割裂玻璃水箱的，他抢过池子的戒指，在水箱上划开一道，然后用灭火器砸开水箱，救出了大宝。

在水中窒息时间超过八到十分钟，生还的几率就会变低，医院里，大宝一直没醒，秦明守了一天，回忆着这些日子和大宝的点点滴滴。林涛包扎好伤口，也一起守着。

终于大宝醒了，说自己想吃煎饼，加两个鸡蛋。秦明答应她一会儿去买，但是同时，大宝的一切的生命特征都在减弱。

解剖室里，林涛找到秦明，问大宝怎么样了，秦明不说话。突然，脚步声走近，谁说我呢。看到安然无恙的大宝林涛很高兴，秦明也偷笑。

林涛接到电话，又有命案发生，三个人再次一起出门去案发现场，为每一个死者查出真相。