五百年前，尚未得道的白蛇在峨眉修炼。峨眉山上有一只蛙面水蛇，靠吞吃其他小妖来增加自己的功力。观音听说此事，给了法海一枚镇魔宝珠，派他去收服这条为非作歹的水蛇。一日，蛙面水蛇又在吞吃小妖，其中一条小青蛇马上就要丧命，已经有了五百年功力的白蛇出现，与蛙面水蛇打斗起来。但白蛇不是对手，也落到了要被吞吃的下场。危急关头，一个拿着竹笛的小牧童出其不意用竹笛打在水蛇七寸之处，暂时解救了白蛇。蛙面水蛇又要发起进攻时，法海赶到，用宝珠收服了他，并将他压在杭州雷峰塔下，又祭起宝珠镇在塔顶。

五百年后，小青已经修炼的法术高强，经常戏耍上山打猎的人。没想到法术却总被白蛇破掉。小青对此心怀不忿。已有千年道行的白蛇想要成仙。观音菩萨前来点化白蛇，问她成仙前是否有未了的心愿。白蛇拿出随身携带的竹笛，说五百年前，这个竹笛的主人救了她一命，自己许愿要报救命之恩。菩萨说，等她了却了心愿自己再来度她成仙，并暗示白蛇去西湖边寻找转世的小牧童。偷偷跟踪白蛇的青蛇见到菩萨对白蛇面授机宜，以为菩萨给了白蛇成仙的秘法，心中既艳羡又好奇，决定跟随白蛇下山，一探究竟。青蛇一路偷偷跟随白蛇来到杭州西湖，见到人间百态，处处觉得新鲜有趣，闹出很多笑话。

雷峰塔里有一个年轻僧人好似泥塑一般在这里坐了五百多年了，一直看守着这座宝塔！这塔镇压的正是当年野心勃勃，欲吞噬天地的蛙面水蛇。五百年来，蛙面水蛇的死忠手下蟾蜍精招兵买马，已经在钱塘江底建立了一座水下之城。为了营救蛙面水蛇出塔，蟾蜍精费劲心力挖通通往塔下的地道，哪知因为有宝珠的震慑，当蟾蜍精触碰最后一块砖石的时候，镇魔宝珠突然发出耀眼光芒，将蟾蜍和一干小妖崩开。法海感觉到妖魔的蠢蠢欲动，告知徒弟要严加看管宝珠。蛙面水蛇的声音却从塔底传了出来：法海，你关不住我，我出山的日子就要到了！

白蛇发现了跟踪自己的青蛇，让她回峨眉山修炼。小青不肯，反倒追问菩萨到底给了白蛇什么成仙的指点，白蛇不予理睬。小青三番几次挑衅，想要激怒白蛇与自己大战，白蛇都不应战。两人且行且斗时，小青看到路旁树上有一个后生（许仙）在爬树够鸟窝！决定惩戒此人一下。小青拔下玉簪化作长剑甩出，要将树枝砍断。白蛇急忙出手阻拦。二人打斗起来。最后，小青的剑还是砍断了树枝，白娘子一面用水袖救起许仙，一面一掌打飞小青。小青摔落在地上，宝剑也断成两截。白蛇严厉地教训小青不该随意出手伤人，小青很不服气：这个小子要伤害窝中的小鸟，就是该打！

小青含怒离去，而白蛇不禁回头望了一眼自己救下的少年，却看到少年从怀中掏出一只雏鸟，继续爬树，把雏鸟送回窝里。白蛇心中一暖，想起救过自己的小牧童，不禁对这个后生多看了几眼。青、白二蛇的斗法惊动了钱塘江底的蟾蜍精，他急忙通过隔空传音报告蛙面水蛇。蛙面水蛇心生一计，决定利用鲁莽的青蛇破除雷锋塔顶的宝珠。

小青到西湖边的紫阳山上寻找紫阳仙草疗伤。遇到紫阳小山神。小山神无意提到紫阳仙草的疗效远远不如雷峰塔上的宝珠好，这宝珠不仅能疗伤还能增加五百年的法力！一听这话，小青怎能不动心？小山神又添油加醋地说，只有法力非常高强的人才能得到宝珠，凡凡之辈就不要去冒险了！小青当下决定上雷锋塔盗取宝珠。然而小青刚一走，这小山神便变成一个小妖，跳入钱塘江中。

小青设计骗开法海，上塔盗宝，却接近不得。原来法海设下咒符，有肉身的都不能接近塔顶。善用花草做法的小青心生一计，利用蒲公英做成一只大手，破解咒符将宝珠取下。不想她刚刚拿到宝珠，突然天崩地裂宝塔坍塌。

没有宝珠震慑，蛙面水蛇重获自由。青蛇，法海不得不与蛙面水蛇交战！法海不小心被蛙面水蛇封在河蚌壳内。小青也被蛙面水蛇打成重伤，眼见要遭毒手，危急时刻，白蛇出现与蛙面水蛇缠斗起来，但也不是蛙面水蛇的对手。就在蛙面水蛇对白蛇致命一击时，突然空中出现一道灵光将白蛇罩住，蛙面水蛇撞上灵光后被震落掉入钱塘江。苏醒的白蛇去寻找青蛇，发现青蛇已不见了踪影。白蛇知道小青犯了天条，赶紧逃跑。

受伤晕倒的青蛇醒来时发现自己被伏魔锁缚住手脚跪在观音面前。菩萨斥责小青放出蛙面水蛇，闯下弥天大祸，人间将因此生灵涂炭，因此要废掉小青五百年的道行作为惩罚。小青认错，恳请菩萨原谅。菩萨告诉她，镇魔珠是蛙面水蛇的最大克星。可是现在因她妄为，宝珠已经失去了镇魔的能力，必须把宝珠带到凡尘去吸取人世间的强大力量才能再次收复蛙面水蛇。菩萨与小青定下一年之约，如果一年内小青能让宝珠重放光芒收服蛙面水蛇就免去责罚。小青领命，重回凡间。二郎神抓住小青，依照天条，小青的过错要被收去五百年修行，但是关键时刻观音出来帮助替小青解围，恳求机会，布置给小青任务，一年的期限。

对人没有什么好感的小青来到人间看到的尽是些尔虞我诈，欺行霸市，鱼肉乡里的种种恶行……宝珠的光芒不仅没有变亮反而更暗了。小青真不知道该去哪里找镇魔的力量。一日，小青来到了钱塘县的“医仙庙”，见众人都在朝拜医仙，便好奇地去看热闹。她发现所谓的医仙不过是个藏在神像里，只会骗吃骗喝的小妖怪，而这个小妖怪居然就是之前唆使自己去盗宝珠的“小山神”！