清凉寺有难韦小宝劝说老皇爷暂时离开清凉寺避难，自己会派少林高僧护送老皇爷下山。谁知顺治却说自己是个不祥之人，他不想再连累大家，执意要留在清凉寺了结一生。

一部分西域圣教尊者围坐在五台山下，韦小宝带着少林武僧成功偷袭了他们，韦小宝让众僧人把西域尊者的衣服都脱下来他自有妙用。

行痴、行颠和玉林三人在禅房内准备好了柴火，只等西域尊者前来，等行痴说明身份，他们就点火焚身了却尘缘。韦小宝、双儿和众僧人穿上西域尊者的僧衣装扮成西域尊者来到禅房，趁玉林大师尚未发觉，双儿就点了三人的穴道，小宝命其他僧人给三人也穿上西域尊者的衣服并护送三人离开。临走韦小宝点了一把火烧燃了清凉寺。

其他西域尊者们看到清凉寺失火以为老皇爷已经被大火烧死就离开了五台山，顺治夸赞韦小宝不伤一人就打退了敌兵。路上韦小宝一行碰到了多隆，多隆告诉韦小宝皇上和皇太后已经来到五台山，住在灵境寺里。

韦小宝带着老皇爷和众僧人暂住金阁寺休息。康熙来到金阁寺要看望老皇爷，谁知老皇爷却决心不见他。韦小宝不忍心看到康熙失望，他在门外一把鼻涕一把泪说康熙和自己一样都是没爹没妈的孩子，老皇爷被小宝打动，康熙父子终于见了面。

康熙禀告父皇太后杀了那么多人，他想处死太后。顺治让康熙不要心存怨恨，做一代明君，永不加赋，造福天下苍生。他让康熙不要再派人来伺候他了，自己要做一个真正的出家人。

康熙就在自己眼前，双儿想起母亲对自己的嘱托，她不知道自己该不该杀康熙，心里很矛盾。

告别父亲康熙对小宝说自己不明白中原百姓为什么那么反感他们，都要反清复明。为了赢得民心康熙决定免去扬州等三地的赋税。韦小宝听后很高兴。

建宁公主也来到金阁寺，她吵着闹着要见父皇，顺治不得已召见了她。建宁请求顺治取消她和吴应熊的婚事，顺治说自己作为一个皇上不可能出尔反尔，而且建宁和吴应熊的婚姻关系到天下太平，他让建宁安心嫁到平西王府好好过日子。建宁无奈，她又逼迫韦小宝去向皇上提亲做自己的驸马。

韦小宝和双儿在金阁寺院子里说话，突然被人点了穴道带到一处农舍，劫持他们的人是吴立身和曾柔。原来王屋派准备天亮后就炮轰金阁寺和灵境寺，他们害怕伤了韦小宝，所以抢先把小宝救了出来。吴立身和曾柔向韦小宝说出事情原委就离开了。

双儿和小宝解开了绳索，韦小宝飞奔到灵境寺让康熙赶快离开。康熙刚一离开灵境寺就被大炮轰成了一片废墟。多隆保护着康熙一路逃跑，途中却遇到了铁虎，铁虎正要下手杀死康熙，双儿赶到用铁链把铁虎绑在了树上勒死了。

韦小宝觉得清凉寺已被大火烧成一片废墟，那里应该是很安全的地方，他让老皇爷和行颠转移到清凉寺休息。谁知皇太后却来到清凉寺找老皇爷清算旧账。皇太后说自己并没有杀死端敬皇后等四人，那些都是海大富为了交差冤枉自己的。顺治不理会她，只说皇太后能点了自己御前侍卫总管的穴道武功一定非常高强。皇太后以为顺治知道了自己的所作所为一定会交待康熙回去怎么对付自己，为了保全自己，她决定先下手为强杀了老皇帝。

这时康熙和韦小宝带着侍卫们赶到清凉寺，韦小宝先行来到寺内，他拿出五龙令制止了太后，太后乖乖的跟着侍卫们离开了清凉寺。顺治让康熙不要再来五台山找自己，要专心专意做一个好皇帝。

康熙夸奖韦小宝办事得力，他决定多在清凉寺停留几日。二人正在清凉寺院内说话，突然一个中年貌美的师太从屋顶飞下来要刺杀康熙，韦小宝眼疾手快，替康熙挡了一剑，他身穿软体护甲，师太的剑被挡了回去，正在师太发愣之时，韦小宝抽出匕首切断了师太的长剑。

师太看自己已失手，她抓起韦小宝施展轻功，带着韦小宝飞出清凉寺。师太带着韦小宝来到京城的景山上，她对着山顶的一棵树流下了眼泪。韦小宝猜想师太一定是前明的皇族，师太决定要和韦小宝一起到皇宫里看一看。

韦小宝来到街上为师太采购食物。韦小宝被师太抓走后，双儿到处寻找他。双儿猜想韦小宝有可能已经回到京城，她果然在京城的街上看到了韦小宝。韦小宝说他非常思念双儿，他一定要娶双儿为妻。

师太带着韦小宝从一条密道来到了皇宫，韦小宝猜想师太一定是陶姑姑口中说的崇祯皇帝的长公主。他带着师太来见陶姑姑，师太说她要到自己以前的寝宫宁寿宫去看一看。陶姑姑告诉师太只要找到八本42章经就可以破了清廷的龙脉。师太决定和陶姑姑暂时回到客栈再找机会杀掉太后。韦小宝离开宁寿宫时画了一幅画留给了建宁。

为了断了建宁的念头，韦小宝让于八赶紧为自己和双儿操办婚事。韦小宝还让于八替自己给建宁公主写了一封绝情书，并通知建宁公主自己今晚会在天香楼与双儿喜结连理。建宁公主看到信后决定晚上到天香楼砸场子。

韦小宝穿戴整齐，胸带大红花，只等双儿前来与自己拜堂。建宁来到天香楼责问韦小宝为什么对自己这么绝情，韦小宝说自己不喜欢建宁，不可能和她成亲，让建宁死了这份心。建宁听后伤透了心。

双儿终于来到天香楼，可是她却说自己不喜欢韦小宝，不能够嫁给他。