南京下令要将郑翊发配到太原,太原早已陷入共党的包围中,明显是个死地,南京此举便意味着放弃了郑翊。郑翊虽已无法避免自己的死局,但她在最后的时间里仍不放弃揪出俞北平的身份。
郑翊约姜平、孙德利等人一同吃饭,由于郑翊的最终结局近在眼前,几人都心情不佳。之后,郑翊靠着姜平提供的情报推测出俞北平同林莎应为父女关系。
同时,郑翊先前曾秘密派宋强去南京查探张瀚民的事情,宋强回来后将查到的结果告知郑翊,原来张瀚民在上海、武汉等地收养了大量共党高级干部的孤儿,并利用孤儿计划资助共党。通过推测和大量事实证据的验证,郑翊等人不难得出张瀚民曾收养过林冲和林莎的结论。
徐文正收到郑翊收集到的证据后,找俞北平交谈。在徐文正的逼问下,俞北平终于承认林莎便是自己女儿,同时也承认了他原名为林有发,在早年曾加入过共产党,但俞北平也再三保证他同共党早已毫无联系。徐文正见他态度诚恳,便相信了他,最后对他做出了撤销军职的处罚。
同俞北平交谈完后,徐文正找到郑翊,告知她自己对于俞北平身份的判断,郑翊对此只能苦笑。随后,徐文正告诉郑翊南京方要对清城实行焦土政策,清城为华北华东交通枢纽,此政策能为国军的长江防线赢得三个月的宝贵时间。徐文正知道谁签署这份文件便是历史的罪人,但为了党国,他只能牺牲自己。
俞北平回到家中,徐咏仪得知了他和林莎的关系后,决定要和他把事情都说清楚。在随后的交谈里,徐咏仪直接挑明了俞北平的共党身份,并提出到香港后便带徐丹妮去美国。
共军攻势凶猛,已经突破了清城的最后防线,如今清城已到了最后关头。特调局高层们召开会议,郑翊在会议上提出要加紧实施撤离计划,并通知各高层南京要对清城实行焦土政策的消息,毁城计划势在必行。
徐丹妮趁俞北平不在家中的时候,偷偷潜入俞北平书房搜查,不料正好遇到俞北平开完会议回来,慌乱下,她忙躲入一旁的衣柜。随后,她看到俞北平正在通过收音机接收密电,心下震惊,不禁对俞北平的身份产生了怀疑。而俞北平此时接收的正是一个他早已完成不了的任务,共党上层指示他利用清城特调局主任的身份阻止国民党的毁城计划。
当晚,俞北平一家人吃饭时,徐文正告知他们务必要在星期六那天离开清城,并果断否决了俞北平想将离开的时间推迟到礼拜一离开的提议。与此同时,郑翊等人正在商讨毁城计划的具体实施,最后他们决定采用通过将燃油灌进清城下水道的方法对清城实行爆破。由于郑翊怀疑程忠义为俞北平的内应,便故意透露给程忠义他们要从五号油库将燃油灌入的假情报,以此来看俞北平是否上钩。而实际上,他们则准备用鱼浦头管道将燃油直接运输至地下水道。
徐文正找俞北平到自己书房,再次强调要俞北平带着徐咏仪和徐丹妮早日离开清城,定好的行程绝不能变。言语中,徐文正已透露出死志,俞北平见此知道自己无法再说动徐文正,只能放弃。
徐丹妮将俞北平接收密电的事告知迟又一,姜平等人听到这话知道这信息肯定能坐实俞北平共党的身份,便派人让迟又一告诉徐丹妮俞北平是在接收党国炸毁清城的指令,并让她把俞北平的用来解密电的那本解密书带来给他看。
共党步伐逼近,清城的百姓纷纷出逃,清城一时间秩序大乱。林莎知道程忠义要第一批前往台湾后,知道郑翊不会放过他,便再次找程忠义劝他离开党国,但程忠义却依然无法被说动。在告诉林莎郑翊要通过五号油库用燃油炸毁清城的消息后,程忠义离开。见自己爱的人一心奔赴死局,林莎陷入深深的沮丧与绝望。
不久,郑翊方便得知了林莎同程忠义分开后,便利用挪动物资的借口接近五号油库的消息。见自己的计划初见成效,郑翊更是决定要充分利用这次机会将俞北平彻底打入万劫不复之地。
林莎同俞北平在咖啡馆接头,由于俞北平要提前离开清城,便把这次任务交代林莎完成,并警告她做事要仔细。
同林莎分别后,俞北平回到家中书房,接收组织的信息。随后,郑翊打电话请俞北平出门,提出要给他饯行。而徐丹妮便趁这时来到俞北平的书房,拿到了那本解密书。
在饭桌上,郑翊试探俞北平对于毁城计划的态度,俞北平则强硬回应。两人对话间你来我往,谁都占不了上风。俞北平内心也知道郑翊根本不同意党国对他的处置结果,这场饭局是郑翊对他下的战帖,郑翊想利用最后一个机会,把他留在清城。
徐丹妮同往日一样去见迟又一,却发现他坐在椅子上,早已身亡,霎时只觉天昏地暗。随后,徐丹妮在桌上看到了迟又一留给她的遗书,在遗书中,迟又一对徐丹妮道明了一切。
原来迟又一早已受不了良心的拷问,最后他选择了自杀,来给徐丹妮最后的警告。正监听迟又一的姜平知道迟又一用遗书把事实都透露了给徐丹妮,便将徐丹妮押入了绥靖总署,好让她接受郑翊的审问。郑翊用迟又一妻子和儿子的死来威胁徐丹妮交出解密书,徐丹妮在死亡的阴影下不知所措,只能大声嚎哭。
由于共党推进迅速,南京对郑翊下指示要求提前实行毁城计划。郑翊便下令清城的人员与物资必须晚上八点前撤退完毕,并抓紧让俞北平上钩。这时,她的下属突然来告知她俞北平用清城局最高职权进入五号油库的消息……
徐咏仪和俞北平在家收拾行李,准备随时出发。在收拾行李的途中,俞北平却发现徐丹妮不见人影,便前往迟又一家找徐丹妮。
而郑翊正在面见徐文正,她将俞北平进入五号油库警戒区的事告知徐文正,请求徐文正派人抓捕俞北平,但徐文正却不同意。与此同时,徐丹妮正关在绥靖总署里,被宋强严刑拷问。在折磨下,徐丹妮始终不松口。
徐文正见郑翊心意已决,只能放低姿态,请求郑翊放过俞北平和他的家人。俞北平是徐文正女儿和孙女以后生活的保证,因此他极不希望俞北平出事。怎料郑翊已先行一步直接向南京取得逮捕俞北平的许可,徐文正见此,只能把俞北平的责任都揽在自己身上,道明一切后果都由他承担,以求得家人的平安。待郑翊离开后,徐文正自杀于书桌前。
俞北平同林莎见面,林莎告知俞北平徐丹妮已落在了郑翊的手里,同时,也将关于毁城计划的探查结果俞北平,他们已经确定五号油库只是郑翊的烟雾弹,真正的运输入口是鱼浦头仓库。俞北平告诉林莎鱼浦头有两条线路,一号线和二号线,并且在二号线上有盲点。原来郑翊目前所依据的地下水道图纸为日本人所绘,而清城最早的地下水道则为德国人所造,因此某些管道并未在日本人所绘的这张图纸上呈现出来,二号线便是如此。经商讨后,他们准备在二号线上做文章,通过改变二号线线路把燃油引到城南的一个废弃油库。
同俞北平告别后,林莎暗自潜入鱼浦头油库,带着炸弹试图引爆油库,不料郑翊早已安排在鱼浦头旁的官兵捉住。与此同时,谢楠带人到鱼浦头的二号路线,试图改动二号线。
特调局内,正在同下属开会的郑翊,得知林莎被捕的消息后,很是得意。郑翊知道林莎专门经受过训练,普通的审讯对她毫无作用,便决定让林莎见徐丹妮,以击溃徐丹妮早已被折磨得痛苦不堪的心理防线。这一招果然凑效,徐丹妮终于扛不住压力,道出解码书就藏在迟又一书房的书柜中。
另一边,徐文正的副官田昱为了让俞北平和徐咏仪安心登上飞机,向他们隐瞒了徐文正的死讯,只告诉他们徐文正早已登上飞往台湾的飞机。俞北平和徐咏仪虽对消息存有疑虑,但最后还是听从了田昱的安排,准备登机。
通过解码书,郑翊等人分析出了共党要对一号线进行行动,当即下令要实行二号线计划。而被关押在监狱里的林莎正在安抚情绪濒临崩溃的徐丹妮,徐丹妮为自己屈从于郑翊的威胁后悔不迭,林莎则告诉徐丹妮,情报不过是俞北平为郑翊设下的一个局,目的便是要郑翊实行二号线计划,好成功利用二号线的盲点。随后,林莎知道自己必死无疑,便鼓励徐丹妮不要放弃活的希望,并让徐丹妮帮忙传递情报给俞北平。
共军分成三路已经攻入清城,清城已注定要被共产党掌控,毁城计划迫在眉睫。怎料本就该出油的二号管线却至今没见油,郑翊听到这消息,心下已凉了一半,如此一来,毁城计划已来不及。 郑翊故作镇定,要下属沿二号线反复排查。
正当这时,城南方向传来了一声巨响。郑翊惊觉爆炸的方向不对,而她的下属也正好前来告知郑翊二号线路被共党拦截,导入的燃油被分流到了城南的一个废弃油库的消息。毁城计划崩盘,郑翊听着城南不断响起的爆炸声,整个人已然疯魔。她将徐丹妮和林莎带到绥靖总署二楼的阳台上,准备让她们看最后一眼清城。
而这时,俞北平和徐咏仪已经登上了飞往台湾的飞机。在飞机上,徐咏仪由于担心徐丹妮等人以及对前途的迷茫,忍不住失声痛哭,俞北平轻声安慰。
阳台上的郑翊指着正飞过头顶的飞机,告诉徐丹妮和林莎,俞北平和徐咏仪便乘坐在这架飞机上,而这架飞机早被她装上了炸弹,在飞行途中便爆炸,到时俞北平便会尸骨无存。林莎和徐丹妮闻言,皆是哀痛欲绝。在郑翊朝林莎开枪的同时,林莎动用余生最后的力量,一个箭步冲上去,反手将郑翊开出的第二枪打在了郑翊身上,并拉着她一起从二楼坠下,最后,两人竟同归于尽了。在转瞬间发生的这一切,让徐丹妮很是难以置信。她望着林莎摔在楼底的身体以及其身后晕开的大滩血迹,痛不欲生。
不久,共产党攻破了清城,徐丹妮也得以解救。从那天起,徐丹妮彻底丧失了她的父母俞北平和徐咏仪的音讯,而她则在多年后成为了清城大学一名教授,安然度过晚年。