但黄栌对龙飞的怀疑却有增无减，同时他看到龙飞不仅重新取得了大家的信任而且还更加让梅香着迷，他不肯善罢甘休，非常生气，并企图施暴梅香，梅香几度挣扎，恰好龙飞赶来制止，梅香开枪打死了黄栌。 黄栌的死引起了特务的不安，黄飞虎为了安定军心，忍住失去爱子的悲痛，让大家不要动摇。但是黄飞虎却改变了计划，暂停了行动。然而肖克他们依然认为特务们会依照假雷达站图计划行动。 梅香派人打开了南云的墓，发现里边竟然是空的。 夏文亭在特务活动里陷的太深，其父亲让他到政府投案自首，他却嘲笑父亲放弃英国的优越生活条件，一厢情愿地回国建设，却被怀疑成特务，真是不可思议。 在行动之前黄飞虎接到了一个电话，让他们马上行动，并改变了进攻方向，没收了龙飞的枪。龙飞面临计划突变只能干着急，无法通知肖克他们计划已改。 原来行动前，黄飞虎接到上级命令，说组织内有卧底，黄飞虎决定带着电影院全体特务撤离，夏文亭要求跟黄飞虎走。 肖克赶来时已经人去院空，公安人员散开开始搜查，向山中转移。这时却一只枪从背后顶过来，肖克呆住了。

那支枪是特务的。 因为天色已晚，只有肖克一人仍然紧追不舍，和大部队失去了联系，反而落在特务们的包围中，黄飞虎让龙飞当众人的面杀死肖克，龙飞艰难地举起枪将肖克一枪击倒在地，叶蕾听到枪声赶来，看到肖克已倒在了血泊中。 黄飞虎等继续向山中行动，众人分散到特务村的各家各户安顿下来，白蔷与龙飞住在山中，龙飞神情恍惚。 肖克被叶蕾送到医院抢救，在医生的努力和叶蕾的看护下抢救过来，肖克接受上级任命，全力追缴特务组织，他发出的第一道命令就是通缉龙飞，龙飞由于失去朋友、妻子情绪很低落，和白蔷无端争吵了起来，失手打了白蔷。赵处长让大家认真总结一下这次行动失败的原因。 山中营地通过电台接到一个代号叫“吉祥”的人发来的命令，要求全体人员按兵不动，等待梅花图的出现，龙飞听到消息后更加着急，寻找机会下山求援，一番惊心动魄的洞穴历险，龙飞终于摸下了山，白蔷发现龙飞独自下山，没有通知手下便悄悄跟了下来。龙飞摸进城里后没想到到处都是通缉他的通缉令，于是撤到医院看肖克。

龙飞探望中枪在医院的肖克，叶蕾这时进来，用枪对准龙飞。龙飞反以叶蕾作人质才得以逃出。 龙飞来到南云墓前，梅香出现，她告诉龙飞南云是她的姐姐，这时公安来搜捕龙飞，龙飞将南云和梅香的照片放在墓前。肖克来到化验室，从化验的结果看，肖克吃惊发现庄美美眼里的微缩胶卷是被南云取走的。肖克一行人追到梅山镇，探寻特务的行踪。但不幸被特务们发现，叶蕾被特务抓走，龙飞被我公安抓住。 梅香在小河边向龙飞讲起了白家三姐妹的事，南云是她的姐姐，叫白薇，她叫白蔷，她还有一个小妹妹叫白蕾。讲起她们小时候的事还有白家老宅以及他们身上的梅花，虽然是同父异母的姐姐却没见过几次面。 三号命令的二级行动是细菌战－－鼠疫。黄飞虎对这种下九流的行动计划嗤之以鼻，拒不执行。他和龙飞被关。 肖克的调查在进行，他们发现南云的真相，原来她不仅没有死，而且也是个特务。