蔡斯的秘密身份曝光，连超查组也加入到了抓捕行动之中，莱拉成为这次行动的联络官。但蔡斯太狡猾，超查组与绿箭小队成员的几次联合行动都扑了空。奥利弗已不再披绿箭战袍，仅是穿着防弹武装服，配上黑色面具。标志性的弓箭也不再使用，手里只有一把手枪。

作为市长，奥利弗受到媒体记者以及普罗米修斯受害者家属的强烈质疑。市政厅几乎天天被记者包围，奥利弗面对那些犀利的问题，有时都不知该怎么回答，只能以案件正在侦查中为借口敷衍过去。更难面对的可能是受害者家属，让连环杀手成为检察官这的确是政府的失职，奥利弗难辞其咎。只有抓住蔡斯，才能向市民有所交待。

费莉希蒂仍必须求助于“螺旋”，只是她没发现螺旋正在利用她达到不可告人的目的。费莉希蒂在不知情的情况下登陆超查组网络，发现超查组的无人机系统正将蔡斯的行动轨迹发到某个探员的手机上。螺旋正是以此定位探员的位置，黑入电梯控制系统，导致电梯突然下坠探员身亡。而探员随身携带的安全密钥落入了螺旋的手中。

就在大家都以为是蔡斯的报复行为时，费莉希蒂发现了电梯控制系统中的秘密代码，便知道是螺旋所为。她没有声张，而是自己去找了螺旋的负责人，阿莱娜。阿莱娜这才承认自己真正目的，救出被超查组羁押的螺旋创始人凯登·詹姆斯。凯登是个前无古人后无来者的黑客，因非法入侵超查组网络而被秘密关押。关押凯登的地点使用的是双密钥开关，还必须得到另一个密钥才能开展救援行动。费莉希蒂原本不想卷入其中，但阿莱娜提出了交换条件，只要费莉希蒂帮忙救出凯登，就可以得到凯登被抓之前编写的生物特性追踪代码。有了这段代码，蔡斯就算逃到天涯海角，也会被搜索到。这让费莉希蒂心动了。

莱拉也察觉到袭击探员事件不像蔡斯的手法，以防万一，超查组中持有安全密钥的人都被安全隔离，只有一人还在赶来总部的路上。绿箭成员即刻上路前往护送，半路上发现有武装份子已劫持了探员乘坐的车辆。黑金丝雀和蒙面奥利弗要打倒这几个螺旋找来的雇佣兵并不困难，可随后赶来的斯巴达阻止了奥利弗的行动，将手机递了过来。电话里费莉希蒂请求奥利弗不要插手此事，虽然不知道原因，但奥利弗还是选择相信费莉希蒂，让雇佣军取走探员的安全密钥。

回到基地的费莉希蒂无疑会遭到莱拉的质疑，而奥利弗和约翰在这件事上也并没有站在她这一边。显然费莉希蒂把抓住蔡斯放在首位，而莱拉则更看重超查组的安全。在这样的分歧下，费莉希蒂愤而离开基地，回到螺旋，完成接下来的营救任务。

奥利弗可能没有想到绿箭小队有一天会去阻止费莉希蒂，各成员分散在超查组总部周围，时刻准备螺旋来袭。哪知莱拉隐瞒了凯登的关押地点，凯登被关押在十九公里外的黑监狱，而不是在总部。等黑监狱发来遇袭警报，众人才发现被自己人耍了。

莱拉确实没想到螺旋如此神通广大，居然会查到秘密黑监狱的地点。费莉希蒂和阿莱娜各持一部平板，关闭监狱设置的自动炮塔和激光防护网，余下的守卫人员由雇佣兵解决。为了不再伤及人命，阿莱娜特意使用了橡皮子弹。黑监狱里是堆积如山的集装箱，用双密钥打开一个集装箱，阿莱娜搀扶蒙着头的凯登撤离。这时绿箭小队赶到，费莉希蒂挺身挡在枪口前，并重新开启了激光防护网。奥利费只有眼睁睁看着阿莱娜带着凯登开车逃走。

因为超查组关押凯登未经过任何法律程序，对外从未公开承认，因此莱拉对费莉希蒂的行为也无法采取法律措施。可当费莉希蒂再次来到螺旋时，发现已人去楼空。她和绿箭的关系让阿莱娜不放心，只能选择事成后离开费莉希蒂。不过阿莱娜没有食言，提供了凯登开发的生物追踪代码。回到基地后，费莉希蒂顾不上理会奥利弗的反应，迫不及待的运行代码。屏幕上快速的刷新着各个方位，最后定位在一个地点，显示蔡斯就在这里。正当奥利弗和费莉希蒂诧异时，面前的服务器突然发生爆炸，将两人重重的抛了出去。

基地完全失去了电力，一片漆黑。弗莉希蒂躺在地上无法动弹，奥利弗跳起来摸黑在四周搜索了一下，并没有发现蔡斯的身影。他这才稍微定心，查看费莉希蒂的伤势。费莉希蒂并没有受伤，而是植入脊髓的辅助行走装置失效，以致于双腿失去了知觉。可以断定，这次威力不大的爆炸是电磁脉冲，地堡里的所有电路因此受损，包括费莉希蒂体内的辅助芯片。现在面临着很大的问题，地堡内的电梯、安全门都无法使用，紧急出口也被焊死，再加上通风系统停止运作，奥利弗和费莉希蒂都不知道能在这个几乎封闭的地堡里支持多长时间。奥利弗觉得蔡斯此举的目的并非是要置自己于死地，而仅仅是为了困住。这让他不禁怀疑蔡斯在外面策划着什么阴谋，最让奥利弗担心的就是自己的儿子威廉。

奥利弗和费莉希蒂被困在地堡里，无法向外界求救，只能自己想办法脱困。奥利弗看了地堡的平面图，打算从电梯井爬出去。费莉希蒂认为蔡斯费尽心思布下这个圈套，不可能留下这么明显的漏洞，其中必有陷阱。果然不出所料，一意孤行的奥利弗刚爬上电梯井顶部就被高压电击中摔了下来，腰上被突出的螺丝扎出了一个洞。费莉希蒂坐在轮椅上，帮着清理伤口，做了简单的包扎。既然电梯井走不了，就只能采用费莉希蒂的办法，利用奥利弗的摩托车发电，尝试恢复核心控制模块。但也不顺利，受损的模块在通电后反而过载，导致旁边的甲烷输气管破裂，有毒易爆的甲烷嗤嗤的冒了出来。

看着破裂的管道，倒是让奥利费想到可以从铺设管道的通道逃生。重新调整了爆炸箭中的火药量后，奥利弗将箭精准的从通道大门通气孔中射到大门后，即炸开了通道门，又没有引爆甲烷。随后奥利弗背着费莉希蒂拉着绳索慢慢下到管道通道。刚才的剧烈运动让血不断从伤口流出，又吸入不少有毒甲烷，再看到通道尽头是个死胡同，奥利弗终于坚持不住，昏了过去。

此时在地堡外，约翰等人也发现了异常。柯蒂斯察觉地堡内没有电力，就猜到了原因。但也出现了一个问题，放在地堡内的T形球受损无法收到他发出的指令。眼看着时间慢慢流逝，众人不知道里面的情况万分着急。雷内试着用电焊切割电梯，差点被地堡内喷出的甲烷火焰烧伤。见情况紧急，莱拉拿出了另一个T形球。在柯蒂斯诧异的目光中，莱拉不得不解释，超查组还负责对新技术的监视，所以才会仿制T形球，以便日后有所防备。约翰本来就对超查组非法拘禁有所不满，如今看到超查组还盗取他人技术，更是不知道超查组到底还有多少见不得人的勾当。

可现在不是追究这些事的时候，当务之急是救出奥利费和费莉希蒂。T形球从通风管道进入地堡，撞开一堵堵围墙后终于在地下通道内发现了奥利弗和费莉希蒂。此时奥利弗的伤口已经凝结，恢复了意识。但事情并没有结束，柯蒂斯发现地堡里的发电机有保险设置，遭遇灾难性攻击后会触发防篡改保护，即强行恢复电力。恢复电力时，很可能会产生电火花，引爆地堡内的甲烷。

事不宜迟，约翰、雷内和蒂娜进入通风管道寻找奥利弗和费莉希蒂，柯蒂斯则试着入侵市政供电系统，为通风系统供电，排出地堡的甲烷气体。奥利弗背着费莉希蒂吃力的沿着通风管道前进，终于在竖井见到了前来接应的约翰。

危险过去了，大家都松了口气。可他们都没想到蔡斯已经找到了隐姓埋名生活在其他地方的威廉，另一场危机即将到来。

因大法官批准重审蔡斯经手的所有案件，大批重刑犯被获准保释。这让奥利费很头疼，只好命昆汀派人监视那些重获自由的犯人，而最危险的犯人桑普森则由费莉希蒂负责。奥利弗边走进市政大楼，边给昆汀安排任务。这时他接到特勤人员的通知，市长办公室收到可疑木箱，寄件人叫西蒙·莫里森。西蒙·莫里森是蔡斯的真名，奥利弗相信他不可能使用邮寄炸弹这样的低级手法，所以奥利弗不顾劝阻，直接撬开木箱。让人吃惊的是，木箱里是一段混凝土方块，中间赫然嵌着具干尸。黛娜根据牙科记录查到死者叫亨利·古温德，是名区议员，2002年失踪，次年被批准死亡。2002年蔡斯还未成年，那亨利、蔡斯和蔡斯父亲贾斯汀之间有什么关系，还需要黛娜继续调查。

西娅听说蔡斯的真实身份后也赶回了星城，希望能给哥哥一些精神上的支持。但她和奥利弗都没想到，已故的父亲也会牵涉其中。黛娜从死者指甲下提取到DNA，经匹配属于罗伯特·奎恩。检测报告里显示包裹尸体的混凝土是由奎恩集团的子公司生产，费莉希蒂对比周边杂质和02年奎恩集团的建筑施工地图，大致确认了案发地点，就在废弃的奥利弗公司。这个公司是罗伯特以儿子的名字命名，因毒气泄漏，已关闭一个月。其他成员在监视桑普森，只有斯巴达和蒙面的奥利弗前往调查。结果失足跌入陷阱，水泥不停的从喷泄口涌了过来。危急之下，黛娜和柯蒂斯只能放弃监视，前往救援。获救后的奥利弗冷静思考后，确定蔡斯是在与桑普森合谋。调查发现桑普森已窃取大量化学品，正是贾斯汀研发的生化武器材料，现在还差一样最关键的原料，环三氮烷。

黛娜和柯蒂斯继续追查桑普森，昆汀和雷内则查到亨利议员在失踪前最后见到的人是律师达伦·考夫曼。达伦与是蔡斯父亲贾斯汀的代理律师，或许这就是两者之间的关联。达伦被请到市政大楼会议室，奥利弗和西娅以非正式的方式与他见面。哪知蔡斯早知会有这次见面，事先给了达伦一个U盘转交给奥利弗。U盘里是父亲罗伯特的罪行，奥利弗不想和蔡斯再玩这种心理游戏。

这时费莉希蒂打来电话，黛娜和柯蒂斯在生产环三氮烷的化工厂发现了桑普森。在奥利弗前往抓捕时，西娅打开了U盘，想看父亲到底是什么样的人。化工厂的行动失败，桑普森抢走了所需的化学品。奥利弗沮丧的回到办公室，看到的是西娅悲痛的脸。U盘里正是父亲与亨利发生争执，亨利意外坠入水泥浇灌立柱的监控录像。父亲的形象在西娅心中崩塌，奥利弗却无从安慰。而在费莉希蒂的劝说下，奥利弗摆脱了父亲的阴影，决定重新披上绿箭战袍。

费莉希蒂从环三氮烷释放出的气体追踪到桑普森很可能就在帕尔默科技大楼，斯巴达和卓越在大楼底层见到绿箭回归，都是精神一振。此时黑金丝雀和野狗在楼顶发现了桑普森，在通往楼顶的楼梯间，绿箭与普罗米修斯狭路相逢。绿箭单独留下对付普罗米修斯，斯巴达和卓越继续上楼协助黑金丝雀和野狗解除即将引爆的生化炸弹。

蔡斯这么做的目的，就是为了缅怀自己的父亲，证明自己和奥利弗是同一类人，都是杀人犯的儿子。可奥利弗说出了一个让他无法接受的事实，贾斯汀曾找达伦商量解除与蔡斯的父子关系。原因并在于蔡斯是私生子，而是他也察觉到蔡斯是个疯子。蔡斯与奥利弗并不相同，罗伯特以儿子为荣，贾斯汀却以儿子为耻。听到这话，蔡斯心灰意冷，弃械投降。

蔡斯被关进了超查组的牢房。奥利弗也毫不隐讳的在记者发布会上承认了父亲罗伯特的罪行，并希望自己有机会弥补父亲的过失，建设更美好的星城。