一日,皇上私下带着宫廷太监总管包公公微服出巡,一行来到竹山县想借此之行顺道见见思念已久的女儿凝香。途中他们遇见打劫贡船的海盗。皇上见此,只身上船帮助官兵抗贼,未料反被押船官朱魁误伤落入水中。受伤的皇上被俞慧心救起。阴错阳差之中,皇上反被误认为水寇首领——混江龙……
因贡船于竹山县被劫,竹山县令杭铁生难辞其咎。密谋夺权的王爷封锁消息,企图置皇帝于死地,遂指派太监崔洁押解铁生进京问罪。途中巧遇凝香,铁生方知原来凝香未死,且凝香亦表明愿陪同铁生一同入京……
因铁生失职之故,朝廷遂指派朱魁接替其职四处捉拿水寇。此时,被误认为水寇首领的皇上亦被朱魁擒获。而无意间发现皇上身份的崔公公,为助王爷夺权大计,便暗令不知情的朱魁欲除去皇上。铁生只得乔装打入水寇内部,并最终赢得首领混江龙的信任。