第九医院的神经内科主任丁学坤注射药物自杀，多年在外的丁学坤徒弟韩西林收到了丁学坤生前寄来的快递，里面是丁学坤多年的医疗日记，而后他又接到院长的电话，得知师傅丁学坤去世。远在瑞典的丁学坤儿子丁远志也接到了父亲去世的通知电话，急忙赶回国。韩西林因为路途遥远，在路上耽搁，以致没赶上葬礼。燕京市第九医院院长司徒秀赢招收丁远志进医院工作，虽然他学的是西医，根本不可能继承丁学坤的衣钵。

所有人都散去了，韩西林才赶到师傅的墓前。当时丁远志也在那儿，他与父亲积怨已深，见父亲最后一面是六七年前，表面上看来，他和丁学坤的感情并不深。韩西林忍不住指责他作为儿子，却对父亲的死如此地冷漠。不管怎样，这次再回到第九医院，韩西林下定决心要查清楚师傅的死因。韩西林多年前曾在第九医院工作过，后因为一些事离开，招他回来后有人议论纷纷，但司徒秀赢不怕，她之所以这么做，也是有她的用意。

生前丁学坤和司徒秀赢因为化瘤丹上市一事，两人之间有诸多的不合，因此丁学坤一死，难免会有传言说丁学坤的死和司徒秀赢有关。当她听到这些话，脸上并无太大的波澜。第九医院正在争取和国外的合作，决定让丁远志和韩西林回来，也是想利用中西医结合这个优势，来争取这次合作。司徒秀赢将丁远志约出，问起丁学坤的医疗日记，丁远志却不知道有医疗日记的存在。不过即便有医疗日记的存在，丁学坤也应该会给韩西林。

九院把丁学坤生前的办公室分配给了丁远志，他和韩西林在办公室内狭路相逢，他们互瞧不起对方，险些扭打起来，幸亏王恒之将他们拉开。王恒之本意是想好好劝说韩西林，韩西林却不领情，反而认为他不相信自己。有一个知名滑雪运动员病人叫谭淼淼，由于滑雪时导致了严重脑挫裂伤，在国际上已经被宣判为植物状态，并且患者脑干后交通动脉还有一个肿瘤，一旦昏迷超过三个月，将变成永久植物状态。

院里召开会议，讨论是否将其接收入院，大多数医生都因其病情复杂严重而建议不接收。丁远志站起来说出自己的看法，他提议对病人实施动脉瘤栓塞介入手术。听完他的理由，司徒秀赢力排众议，决定接收病人入院，让丁远志做手术，因为此时正是需要吸引媒体和国际的重要时刻。韩西林却说不能让患者在昏迷的状态下动手术，否则后果不堪设想。他建议用中医的方式来进行促醒，如果无法在两周内促使病人醒来，他就离开九院。

很快，谭淼淼被接收入院。年轻的潘小艾医生当韩西林的助手，去老式中医楼叫韩西林过去开会，但韩西林桀骜不驯，并没有去参加。丁远志想起司徒秀赢的话，遂问韩西林关于医疗日记的事，韩西林没有否认，他说把医疗日记给丁远志也可以，但丁远志要以直系亲属的身份去公安局签字，丁远志并没有答应。韩西林拿来一大堆谭淼淼的东西，让潘小艾把病房布置好，自己却走了。

韩西林将布置病房的任务交给了潘小艾，虽然这是促醒环节的一部分，但很多人都认为这是在故弄玄虚。看到患者的母亲有疑惑，韩西林简明扼要地解释这里的每一部分都是促醒的关键。观察完患者的情况，韩西林决定先把她体内的湿气去除。一切结束后，韩西林叮嘱医护人员密切关注患者的体征。谭母看到医生没给女儿用药，不禁有些担心。神经内科主任林雅婕安抚谭母情绪，让她相信医生的判断。

谭母在女儿的病床前，想起以前自己对女儿的苛刻要求和严厉惩罚，顿时追悔莫及。韩西林将纸巾递给她，心有触动。后来谭母听自己的一个医生朋友说女儿现在不动手术，后果将会十分严重，因此她和院方提出停止促醒，尽快给谭淼淼动手术的要求。林雅婕赶忙安抚，并表示尽快开会讨论此事。丁学坤和丁远志之间积怨之深，让丁远志不愿留下父亲的任何东西，他让王恒之把丁学坤的书籍和遗物丢掉，王恒之没有丢，而是把东西拿来给韩西林。

王恒之问韩西林以后的打算，韩西林没有回答，反而问他关于丁学坤的真正死因。只是王恒之还没回答，就接到了要去开会的电话，随后他带韩西林去开会。韩西林不同意终止促醒，更不同意加大药量，因为促醒最怕急功近利。会议讨论的结果，是以两天后为期，届时如患者还未醒来，就终止促醒，直接进行手术。两天的时间实在太短，几乎没有人相信韩西林促醒会有效果，除非有奇迹出现，此时网上出现了负面新闻，加快了此事的进程。

韩西林一直在默默思索，到底是哪里出了问题，导致患者没有醒来。潘小艾的一句无心话，让韩西林想到或许是佩兰这味药用了干的，导致药效减半，当晚他直接开车外出去找鲜佩兰。司徒秀赢过来查看病人的情况，韩西林还没回来，林雅婕只得让另一个医生汇报一下患者的情况。听完后，司徒秀赢直接下决定，将手术提前到明天中午十二点。林雅婕却以不能违反神经内科针对疑难重症多科会诊流程为由，帮韩西林拖延了一些时间。

虽然韩西林不见人影，所有人都不看好他，但潘小艾觉得韩西林有可能是去找促醒谭淼淼的方法了。第二天开会投票，林雅婕和王恒之都表达了自己的观点和看法。让人意外的是，丁远志也赞成他们的想法，最终众人又继续按照原计划执行。规定时间马上就要到了，就在大家都以为韩西林的方法不起作用的时候，潘小艾急忙跑过来告诉他们，谭淼淼醒了。这无疑是一个大好消息，众多医生赶去谭淼淼的病房，亲眼看到谭淼淼的手指有了反应，虽然她此时还没能睁开眼睛，但她已经恢复意识。

韩西林的工作暂时告一段落，他抽时间去看以前的一位老叔叔，他看到韩西林回来，既意外又惊喜。

老叔提起一件事，再过几天就到了韩西林母亲的祭日。一个小病人小山进入谭淼淼的病房，十分羡慕这个病房的布置。得知小山的母亲因为工作忙，都没怎么来医院看小山，潘小艾于是安慰小山。谭淼淼已经醒来，韩西林去问司徒秀赢要丁学坤病例，司徒秀赢将丁学坤的抑郁症治疗记录交给了他。韩西林想要丁学坤死时的视频，但因为他不是直系亲属，所以没有拿到。丁远志对韩西林很了解，但韩西林却嘴硬地不肯承认。

王恒之和林雅婕商量，想跟院里提出要让韩西林留在九院。林雅婕知道他之所以想让韩西林留下，是想让他继承丁学坤衣钵重启改良化瘤丹的工作。虽然韩西林有能力，但性格不稳定，所以林雅婕的意思是尽快让韩西林离开。她还提醒王恒之，有些事他们科内需要先商量，不能贸然上报。只是司徒秀赢让韩西林留了下来，两年前韩西林擅自给护士林晓燕用药，这件事在院里不是什么秘密，因此韩西林还能留下，着实让人感到意外。

韩西林留下来后，丁远志让人告诉他，所有的要求都要按照副主诊的要求来做，查房、问诊一个都不能少。后来查房的时候遇到一个生病的大妈，他直接让大妈走了直线，然后进行诊脉检查，就知道大妈身上有一个痰包。寥寥几句，他就给出了接下来的疗诊方案。有一个病患小男孩，出现了智力下降、小便失禁的症状，韩西林无意中在公园中看到高远山小朋友，遂和他聊了几句，他注意起这个患者，便去参加了丁远志的会诊。

会诊的结果是让小山做一个腰穿检查，他是一个很乖的孩子，做腰穿的时候根本不哭，甚至还睡着了。韩西林于是想到，或许高远山的疾病已经累及到了上行网状激动系统。一天工作结束，韩西林想起之前问过丁学坤的学生，他们都表示丁学坤最后一次课后，结束语有些奇怪。王恒之来找韩西林谈话，他的意思是韩西林不能在这里久待。韩西林以为他对丁学坤的死无动于衷，不禁有些生气。王恒之告诉他，丁学坤生前在九院的压力太大了。

此时另一边的林雅婕也在问丁远志，而丁远志说如果真要留下什么，那也只能是给韩西林。从司徒和人打电话的情况来看，丁学坤的病历她似乎让人动过手脚，丁学坤的自杀更显得疑虑重重了。经过检查，初步认为小山罹患的是肾上腺脑白质营养不良，这是一种很严重的基因疾病，需要小山的父母来做基因检测，确认致病基因的位点，才能对症治疗。韩西林补充，需要减少小山对于长链脂肪酸的摄入，换句话来说，小山最爱的炸鸡不能再吃了。

小山的父亲对于做基因检测这件事有些犹豫，等小山的母亲来到医院，得知了儿子病情严重，这个一直在医院照顾小山的男人才说，他其实姓陆，不是小山的亲生父亲，而现在他们也确实无法让小山的亲生父亲来做基因检测。