在巨石碑崩塌之前，莲太郎等人还是像平常一样生活。为了分散注意力，莲太郎仍是前去帮外围区的“受诅之子”上课，并带她们去参观“回归之炎”，告诉她们回归之炎代表的意义，并察觉到，宿毕五攻击32号巨石碑，似乎有什麼特别的义意。在那同时，因为人们憎恨原肠动物，继而牵怒“受诅之子”，街上开始有人想要攻击“受诅之子”，到最後甚至用炸弹攻击外围区‧‧‧‧‧‧。

保卫巨石碑的战争开始了，里见等人和其他民警辅助部队一起投入战场。战斗中，里见他们发现有一支原肠动物的分队可能会对他们形成夹击，却没有其他人发现，於是里见无奈之下只好带著他的辅助部队擅自离开大队前去檄灭那个分队。结果却间接导致我堂团长的儿子死亡，我堂团长公报私仇，要里见独自一人去击杀毕宿五的左右手－－会用水银攻击的原肠动物“昴宿星团”。

在蛭子影胤的帮助下，里见莲太郎成功找到昴宿星团，并且和影胤联手消灭了它。但毕宿五也开始迁移，圣天子的火力支援下，仍也无法摧毁拥有不死之身的毕宿五。而当莲太郎回到营地时却发现我堂团长已死，根据规定，将由下一个IP排行最高的人接任团长之职，而那人就是－－莲太郎。莲太郎将最後决战的地点定在“回归之炎”，他能带领辅助部队顺利消灭毕宿五，拯救东京地区吗？