本来小宝想乘机轻薄阿珂,阿珂不从只好放她下山,但他发誓一定要娶她为妻。 克爽不知阿珂已下山,带同蒙古王子葛尔丹和巴颜上少林寺救阿珂,而小宝以他的聪明才智,令克爽等人知难而退。圣旨到,原来康熙命令小宝上清凉寺当主持,实则是保护顺治。 五台山的清凉寺被数千名喇嘛包围,目的是活捉行痴大师(顺治帝),小宝只好施行金蝉脱壳之计,假扮喇嘛带行痴等人逃离清凉寺,半途遇上微服出行的康熙。
顺治经不起康熙的苦苦哀求,父子终于相认,而顺治亦将四十二章经的秘密告诉康熙,叮嘱他要做个好皇帝。 康熙在殿内参拜时,九难来刺杀他,幸得小宝舍命相救,被九难劫走。小宝为了脱身,再次利用刺杀鳌拜之事说服九难。适逢每年三月都是明崇祯的死忌,于是九难便带小宝去京城,上煤山拜祭崇祯。 康熙为半个月都未能找到小宝下落,怒责明珠、索额图等四人,更设定时限要他们办到。建宁无意中知道小宝出事,逼索额图等详细讲出,更向康熙透露自己喜欢小宝,要他尽法救小宝。
入皇宫,九难逼太后说出四十二章经的秘密,二人更大打出手,九难将太后的化骨绵掌转移到她身上,太后为了自救,说出她是明代后人毛东珠,真太后被她软禁。 九难发现四十二章经的封面内藏有细小羊皮,必须集齐八本才能并出完整地图。 九难带小宝来到崇祯陵墓,再遇阿珂,九难知阿珂不喜欢小宝,故意处处维护小宝,令阿珂非常生气。 双儿四处寻找小宝不获,而小宝得知九难是阿珂的师父,对她照顾周到,深得九难喜爱。