刘文书再次来到实验站，自称以后就是这里的人了，要和他们同吃同住，口口声声要做政治思想工作，郑君很讨厌他，唯恐避之不及。

许静芝去工作，让邵红柳留下来照顾许牧，邵红柳特意做了许牧最爱吃的煎蛋，可许牧醒来不但要找许静芝，还说自己喜欢吃煮鸡蛋，邵红柳也只好认输，而且许牧不喜欢她做的布老虎，手里一直抱着许静芝做的羊，还自称是林凡清的羊，邵红柳煮好鸡蛋，发现许牧不见了踪影，许静芝正好回来，她看到桌上羊头的方向，就知道许牧去哈里木家了，这是他们母子俩约好的暗号。

许静芝陪邵红柳来到哈里木家，发现他赌气藏在被子里，还念念不忘邵红柳多给他加火柴的事。邵红柳本来想把许牧带回去住几天，可是看他离不开许静芝，还对自己耿耿于怀，回去的路上一言不发独自生闷气。

吴团长收到刘文书的汇报，埋怨林凡清和齐怀正思想太保守，做事畏首畏尾，吴团长让刘文书下达他的命令，要把实验站百分之八十的二代邵氏羊做横交实验，林凡清和郑君坚决不同意，这对羊群是灭顶之灾，刘文书口口声声称这是政治任务，必须严格执行，齐怀正向吴团长说明理由，可是吴团长固执己见。

齐怀正故意隐瞒了种羊的数量，只拿出240只做实验，其实实验站有630只种羊，林凡清让郑君帮邵红柳他们把多出的种羊藏到土匪的根据地，吴团长突然来到实验站，让刘文书仔细核对数量，刘文书想带吴小豆去，齐怀正派杨北斗协助他，吴团长没有看到杨月亮和邵红柳，立刻派人把她们俩找来开现场会，刘文书核对无误，吴团长才悻悻离开。

林凡清和郑君开始种羊横交实验，齐怀正全力支持他们，结果横交实验失败，羊羔全部胎死腹中，林凡清急得一筹莫展，立刻找畜牧厅的童大夫求助，兽医专家魏大夫带来急救药，让林凡清先注射在十只种羊身上，魏大夫觉得是条件还不成熟，就急于做横交实验造成的，经过大家紧急救助，种羊死亡率控制在百分之十，林凡清和魏大夫进行解剖，发现种羊很健康，死亡原因是难产，魏大夫和所有人员齐心协力人工助产，最大可能地挽救种母羊和羊羔的性命，吴团长把责任全怪在林凡清和齐怀正身上，谴责他们没有完成战略任务，林凡清一心就想救活羊，对吴团长置之不理，郑君冲进来强烈谴责吴团长，齐怀正主动承担事故的责任。

与此同时，巴图尔从齐怀正和林凡清偷偷藏起来的种羊中，拿出十只做横交实验，取得了成功，林凡清认为是自己实验的某个环节出了问题，是他的失误造成了上百只种母羊的死亡，魏大夫想解剖巴图尔的种羊找原因，林凡清很自责。

齐怀正对林凡清好言相劝，可是林凡清还是觉得自己犯了不可饶恕的罪过。林凡清一夜未归，他赶到总场向吴团长坦白藏了300多只羊，吴团长觉得他的决定毁了整个战略目标，林凡清明确指出吴团长的决策是错误的，他愿意承担实验失败的责任，吴团长极力撇清自己，把林凡清关了禁闭。

刘文书奉命来到实验站，因为林凡清被关禁闭，由他全权负责牧场和试验站的所有事务，郑君不服气，和刘文书据理力争，邵红柳立刻骑马来陪林凡清，郑君来找吴团长理论，也要陪林凡清一起坐牢，与此同时，齐怀正去找柴师长告状。

林凡清埋怨郑君太冲动，应该留下来照顾种羊和羊羔，可是珍君已经心灰意冷。柴师长狠狠教训了吴团长，他立刻把林凡清放了出来。林凡清带着小豆子来到巴图尔的家，要杀他一只种羊做解剖实验，四个多小时过去了，林凡清由于过度劳累，急火攻心晕倒在手术台上，郑君继续解剖，发现种羊的肌肉密度太小，不能再一味按照国外的喂养方式饲养。

许静芝紧急抢救林凡清，林凡清心里压力太大，一时无法承受这样的打击，邵红柳和许静芝都不知道怎么安慰他，就让许牧去安慰鼓励他，许牧稚嫩的歌声让林凡清压抑的心情渐渐释怀，林凡清很快好了起来，和郑君他们一起总结经验教训，继续开展羊群改良的工作，取得了前所未有的成绩。

转眼间四年过去了，林凡清要去北京参加全国科技表彰大会，吴团长亲自来送他，并真诚地向他和郑君赔礼道歉。林凡清走后，刘文书就对郑君挑拨离间，科研成果都被林凡清一个人拿到了，他替郑君打抱不平，可是郑君却是心服口服，刘文书竟然厚颜无耻替自己争功，还让郑君替他做出文字证明，郑君气得哭笑不得，坚决不写，刘文书对他威逼利诱。

齐怀正和郑君一起去牧业队考察，杨月亮想好好照顾美月，可美月心里只有齐怀正，根本不领情，还笑话她没上过学不认字。林凡清开完会回来，发现大街上贴满了大字报和条幅，他想向师长汇报工作，才知道师长去开会了，林凡清直接回到实验站，随后，许静芝带许牧来看林凡清夫妇，齐怀正和林凡清都感觉情况有点不对劲，只能静观其变。

刘文利摇身一变成了革委会主任，他对吴团长威逼利诱，逼他揭发林凡清和齐怀正的反革命行为，吴团长坚决不干，刘文书宣布上级命令对他就地免职，吴团长宁可去马场喂马，也绝不揭发林凡清和齐怀正，刘文书气得咬牙切齿，当即决定今晚就揪斗林凡清和齐怀正。

杨月亮发现两辆大卡车奔实验站而来，邵红柳决定正面应对，让杨月亮去拿棍子。

吴团长被发配到马棚，齐怀正被刘文书下放到学习班改造，邵红柳得知柴师长也被送进牛棚，觉得世道变了，林凡清坚信朗朗乾坤不会让小人当道，齐怀正趁人不备，偷偷冒着暴风雪连夜来到实验站，劝林凡清和郑君去躲一躲，因为刘文书明天就要带人来抓他们，但林凡清不愿意扔下视之如命的羊群和实验站，郑君坚决和林凡清一起面对，林凡清不想连累齐怀正，让他赶快回去，齐怀正很着急，苦苦恳求也无济于事，最后，齐怀正跪下求他们离开，林凡清信誓旦旦表示要像个男人一样堂堂正正面对，齐怀正无奈，只好含着眼泪赌气离开了。林凡清和郑君站在暴风雨中大声呐喊，邵红柳和杨月亮也和他们勇敢地站在一起，共同面对接下来的狂风暴雨。齐怀正一回到农场就立刻打电话给李国祥求助。

李国祥让塔北县公安局把林凡清和郑君带走，就是避免他们被刘文书陷害，刘文书赶到实验站扑了一个空，立刻派人去查，才知道是齐怀正走漏了风声，刘文书气得咬牙切齿，立刻把齐怀正找来兴师问罪，齐怀正矢口否认，还故意转移话题，刘文书看出齐怀正和李国祥合谋，表面上是抓人，其实是把林凡清和郑君保护起来，但是忌惮他是战斗英雄，也不敢轻举妄动，齐怀正威胁要揍他。

李国祥把林凡清和郑君安置下来，不许他们离开半步，可林凡清坚持要和刘文书斗争到底，李国祥无奈，只好让许静芝劝林凡清和郑君，林凡清不想当逃兵，更不想因此连累齐怀正和李国祥，许静芝声色俱厉地谴责他们，为了自己的尊严不惜让亲人和朋友做赌注，林凡清和郑君被说得哑口无言，幡然醒悟，答应暂时到花鹿沟后山避避风头，还可以在那里建立实验站。

许静芝护送林凡清和郑君来到花鹿沟，李国祥还给他们捎来两只枪防身，任务是在边防站岗放哨，而且出山的时候必须交出一批良种羊。刘文书让杨北斗一个星期之内找到林凡清和郑君，就答应让他做小队长，杨北斗受宠若惊，立刻陪刘文书去实验站视察，在羊圈里挖出了了当年他偷吴小豆的日记本，杨北斗想把日记本还给吴小豆，刘文书才说吴小豆犯错误了，现在在总场的学习班。