贾员外的病情加重,仵作检验出依华的药方并无不妥,故而林氏被关入大牢。依华因此心情沉重,云归陪依华上山采药散心,两人来到依华经常采药的小路,云归询问药材的属性,依华想起如果误食一种叫美人面的药材,就会产生跟贾员外一样的症状。
两人回到慈华医馆的时候,林氏的兄长袭击了依华,云归出手相救并制服了林氏的兄长。林氏兄长埋怨依华不仅没有救回妹妹还害得她入狱,依华解释了一番让他配合自己查出真相。十分感谢依华的林氏兄长知无不言,但他确实从没听过龙虎丸这种偏方,为此依华想要入狱见一见林氏。依华欲找方程天帮忙被裴莺莺拦下,她让依华不要跟方程天玩儿暧昧,依华坦荡的表示方程天只是自己的朋友。了解事情缘由后,事事以方程天为先的裴莺莺表示自己可以帮依华进入大牢,而方程天身为捕头不能做知法犯法的事情。
裴莺莺偷了裴秉明的令牌带依华进入大牢,林氏有些埋怨依华,依华让她冷静下来回答自己的问题,林氏告诉依华,龙虎丸是住在高崖村的龙虎天师给她的。另一边,发现令牌丢失的裴秉明万分焦急,但守卫森严的县衙一般人是无法轻易进入的,裴秉明想起裴莺莺反常的举动便让方程天去寻找她。方程天到裴莺莺房间让她交出令牌,嘴硬的裴莺莺不肯承认还请方程天离开,方程裴觉得裴莺莺还在介意自己怀疑她的事情,裴莺莺矢口否认。裴秉明亲自拿回令牌,情急之下打了裴莺莺一个耳光并罚他禁足一个月,没来得及阻拦的方程天关心裴莺莺是不是被打疼了,裴莺莺别过脸拒绝了方程天的关心。
罗英年跟秦月凝把酒言欢时,罗英年问她为何帮林氏找依华帮忙,秦月凝表示自己曾受过林氏恩惠,如今的情形下,即便自己无计可施也不会对林氏的事坐视不理。罗英年告诫秦月凝不要插手林氏和依华的事情,就像浮游不可撼动大树一样,千万不要自以为是。圆滑的秦月凝笑着说罗英年喝多了,罗英年拿起酒壶狂饮起来。罗英年派人清除祥云县及周边的美人面,事情结束后,罗英年打开屋内的暗格,里面装着金银和一个木盒。
云归陪依华去高崖村的路上,依华被陷阱捕获,云归及时出手,他不仅救下了依华,还跟依华联手抓住了设置陷阱的人。等人醒来后,依华和云归拿着食物引诱他说出实情,这人抵挡不住鸡腿的诱惑说出自己就是龙虎天师,这让依华和云归大吃一惊。
据龙虎天师交代,阴士昭利用药草美人面提炼出了能让人上瘾的银珠粉和能壮阳的龙虎丸,银珠粉的生意由罗英年接手,龙虎丸的生意则交给了龙虎天师。因为罗英年便铲除了祥云县附近全部的美人面,没有美人面做药引,龙虎丸也就没办法生产,所以龙虎天师才做起劫道的生意。
贾员外的大夫人叫嚣着要判处林氏,裴莺莺说服裴秉明等依华和云归的调查结果,公堂之上,赶回来的云归和依华要再次给贾员外诊治。依华云归开始给贾员外重新配置药方,裴莺莺守在门口帮两人把关,吐出毒素的贾员外终于苏醒并说出在吃龙虎丸之前曾服用罗英年开出的药。狡猾的罗英年早早的将药方交给了方程天并解释这一切都是误会,林氏被无罪释放。依华和云归感谢裴莺莺的帮助,裴秉明也因为裴莺莺的成长感到欣慰。
依华带着云归连夜离开,却不想在半路遇见了要与他们同行的方程天和裴莺莺,方程天告诉云归,自己是为了保护依华而来。依华奇怪裴莺莺为什么要跟来,裴莺莺表示真爱一个人的时候,即便想了千万次要放弃,但在看到那人的时候就什么都不重要了。
四人一入京城便被阴士昭的人盯上,阴士昭的人趁裴莺莺下楼取被的时机将依华绑走,找不到依华的裴莺莺将情况告知云归和方程天,三人连夜开始寻找。阴士昭来见依华并告诉她,云归就是叶士礼的独子,而自己之所以没有直接杀了她是因为她还有利用价值,依华担心阴士昭用自己对付云归,她趁小二来送餐的时候将特制的驱蚊粉洒在了小二的身上。毫无头绪的三人在客栈楼下商议,云归闻出小二身上驱蚊粉的味道,通过跟踪小二,云归找到了虚弱的依华。
方程天和裴莺莺扮成依华和云归的样子帮他们引开追兵,方程天问裴莺莺这么做是不是为了云归,裴莺莺觉得他太不可理喻了。大战一触即发,虽然两人异常勇猛却抵不住敌众我寡的形势,眼看一支飞箭射向方程天,裴莺莺奋力一跃帮方程天挡了下来。裴莺莺受伤,两人被关进大牢,方程天想帮裴莺莺请大夫却被看守嘲笑不自量力。真的要失去裴莺莺的时候,方程天才明白自己的心意,他告诉裴莺莺要坚持下去,自己会把她娶回家,如果裴莺莺死了,自己则不会独活,裴莺莺让方程天好好的活下去。
依华和云归逃出京城却忧心如何救出方程天和裴莺莺,依华提出去告御状揭穿阴士昭的阴谋,云归担心没有美人面做证据无法告倒阴士昭,思考良久后,云归要带依华去见一个人。
经历过种种事端,再加上依华的提醒,云归恢复了叶向时的记忆,他带着依华找到早已隐世的太师公,太师公曾教授过三个学生,一个是偷走半本药王手札的依华父亲,另一个是为人正派却遭灭门的叶士礼,还有一个是被他逐出师门的阴士昭。
云归想要太师公种植的美人面,装疯卖傻的太师公打了云归一顿,依华心疼的上前查看,太师公表示自己吃了谁的喜酒便把美人面送给谁,无奈之下云归跟依华举行了婚礼,如愿吃上喜酒的太师公把美人面给了云归,他偷偷告诉云归,自己早看出云归跟依华两情相悦,所以才成人之美的。拿到美人面的依华跟云归开始计划第二天告御状的事情,随后两人又浪漫的看起星星。
第二天云归醒来后发现自己浑身无力,而桌子上是依华留下的字条,为了保护云归,依华要一个人去找到寺庙进香的太后告御状,太师公感叹两人的深情便帮云归医治。另一边依华如愿见到太后,在官兵的威胁之下,胆大心细的依华将叶家灭门和阴士昭的计谋统统告诉给了太后,太后却觉得云归让依华只身前来是没担当的表现。身体好转的云归赶到寺庙,为了考验二人,太后让两人分别说出对方要活下去的原因,云归表示医者仁心的依华活着能救治更多的人,依华直言自己爱云归,所以她要云归活着。两人的话打动了太后,得到了面见皇上的机会。
本就因利而聚的罗英年和阴士昭倒戈相向,阴士昭派人杀罗英年失手后,罗英年将阴士昭制作银珠粉等罪证交给了秦月凝,秦月凝跟太师公一同来到朝堂之上。云归讲出自己当时受父亲叶士礼的指派到祥云县告知百姓美人面的毒性,却不想中途突闻家中噩耗,同时又被阴士昭的人追杀,阴士昭试图狡辩,却在云归和秦月凝的证据面前无法再掩饰。阴士昭的狼子野心让皇上十分震怒,命人将阴士昭关入打牢,同时为了嘉奖叶家的忠烈,皇上命云归入太医院任职并给予云归六品的官职,看着云归回归自己的真实身份,依华默默地离开。
得到医治的裴莺莺保住了性命却一直昏迷不醒,方程天在她床边告白希望她早日醒来,冥冥之中受到感动的裴莺莺醒了过来,确认了方程天真心的裴莺莺亲吻了方程天。
云归终于明白依华为什么说两人根本不是一路人,为了跟依华在一起,云归决定回到慈华医馆。采药回来的依华看见云归既感动又心疼,两人对视时眼中都喊着泪水。