电影《你好世界》结局：生活在2027年的十六岁高中生坚书直实，有着无法融入周围环境的内向性格，既不善交际且缺乏决断力，却因他爱看书，从而推选为图书委员，并与同班女生一行琉璃交换联系方式。面对这个看似突如其来的小插曲，坚书直实毫不在意，直到他被一只三脚乌鸦引到了鸟居，神秘帽子男的出现，彻底打乱了平静的生活。神秘男自称是来自十年后的坚书直实，至于现在所见到的东京，无非是量子储存装置里的虚拟世界。
按照神秘男的解释，alltale装置不仅会记录地图，还会记录社会全貌，包括所有人，所有事物，以及所有过去，就连坚书直实也是一段历史数据，神秘男来此目的就是为了打破数据，避免恋人重蹈覆辙。起初坚书直实不是很理解神秘男的意思，可当看见神秘男望向琉璃的伤感神色，这才恍然大悟。原来现实世界的“坚书”与“琉璃”交往没多久便出意外，琉璃在花火大会上被落雷击中，继而当场离世。即便现实结局无法改变，但是坚书依然深爱琉璃，难以释怀，所以决定记录下琉璃活着的世界，只要看到她露出笑容就心满意足。正因坚书属于虚拟状态，无法触碰任何实物，只能求助于直实，还向十年前的自己弯腰低头，拜托他能帮忙拯救那个女孩的未来。经历这一系列的不可思议，直实答应坚书的请求，同时拥有了乌鸦所幻化的神之手套，可以通过手套运算修改alltale数据库，投影出任何东西，但是投影的数据越复杂也越难实现，所以需要每天加强训练。直实拿到曾经的日记本，上面记录着他和琉璃的故事，只要根据日记本上的行动轨迹，必然能够重现历史，收获爱情。然而一行琉璃是个连手机都不熟练的科技盲，在外人眼中很是高冷，想要让讷口少言的直实执行攻略，实在是一件难以克服的任务。随着接下来的接触，直实逐渐意识到这个平日里看似冷漠的女孩，实则有着不为人知的温柔与可爱，他也在一次活动中，擅自用手套复原琉璃被烧毁的书籍，计划之外的举动促进了表白，顺理成章地谈起恋爱。时间很快来到花火大会，直实没有按照日记那般邀请琉璃，而是选择守在她家门口。不料此时出现大量狐面人，因为系统检测到数据异常，便会自动开启修复系统，强行把琉璃传送到事故发生点，甚至召唤出落雷，打算让程序复原，数据迭代。眼见琉璃陷入危险处境，直实在千钧一发之际，连忙投影出小型黑洞，顺利抵消掉雷电。正当直实跟琉璃解释情况，一段恋情即将开始，没想到坚书突然召回乌鸦，变化为牢笼将琉璃囚禁。失去手套的直实变成普通人，只能眼睁睁地看着坚书带走琉璃，并从这场变故中得知一行琉璃尚且活在人世，只不过被雷击中后彻底昏迷。悲痛欲绝的坚书深感无力，直到看见alltale装置创造者发布的文章，仿佛像是在无尽深渊中看见一丝光明，从此便废寝忘食地学习，成功进入研究所，一遍又一遍的实验令他遍体鳞伤甚至导致身患残疾，依旧没有放弃。整整十年等待，终于等到心爱之人的苏醒。坚书发现数据异常产生严重的连锁反应，不得已选择重置系统。系统修复者狐面人开始疯狂吞噬虚拟世界，整个世界将要面临颠倒、崩溃乃至毁灭，直实试图奔跑躲避，奈何已是徒劳，就在他等待死亡的降临，没想到乌鸦突然出现。一束光芒从天而降，打开了通向现实世界的大门，乌鸦被直实所感动，愿帮助他夺回琉璃。此时醒来后的琉璃，察觉到眼前的男人并非是她所认识的直实。面对恋人的疏离与排斥，坚书失落不已，可是最令他感到震惊的，便是虚拟世界的狐面人竟从外面闯入。狐面人控制住坚书，欲要杀死琉璃，关键时刻，直实穿越而来将二人解救。源源不断的狐面人从远处袭来，一场追逐大战即将爆发，直实在坚书和乌鸦的帮助下，用手套生成量子变换门，便于琉璃依靠变换门抵达虚拟世界。临走之前，琉璃主动拥抱坚书道别，并向他表达感谢。然而琉璃前脚刚走，狐面人已组成巨大Boss，疯狂袭击留在原地的坚书直实。因为狐面人真正目的是为了迭代，所以坚书决定牺牲自己，在危险时刻挡在直实面前，化作光而消失。研究室所长为避免事态恶化，立即停止量子计算机的自动修复，解除限制后的系统数据膨胀，相当于宇宙大爆炸，产生的巨大光芒将直实吸进虚拟世界，他与幻化为十六岁的琉璃，手牵着手迎接新世界。几秒过后，坚书缓缓睁开双眼，站在床边的琉璃喜极而泣，身旁两侧都是实验人员的欢呼雀跃，以及熟悉且陌生的现实世界。因为琉璃的温暖拥抱，坚书这才想起自己为保护琉璃而陷入脑死亡的事实，原来从始至终，琉璃都在守护着他，创造了无数个虚拟世界。